En cumplimiento a lo establecido en el marco normativo local, las diversas áreas del Instituto así como las Comisiones del Consejo General (en labores de vigilancia y supervisión), aprueban cada ejercicio sus respectivos Programas Anuales de Trabajo (PAT). En dichos Programas, mediante líneas de acción y subactividades se establece lo que cada área estará realizando y ejecutando en cada ejercicio, incluidas actividades tanto de periodo ordinario como de proceso electoral. Es preciso señalar que los Programas Anuales de Trabajo se encuentran acotados al presupuesto aprobado para cada ejercicio para con ello garantizar el contar con el recurso humano, técnico y operativo suficiente para el correcto cumplimiento de cada línea de acción establecida en los PAT.
Las Comisiones del Consejo General, tanto permanentes como temporales, realizan labores de seguimiento y vigilancia de acuerdo a sus respectivas atribuciones conferidas en el marco normativo local, y de igual forma aprueban sus Programas Anuales de Trabajo en dicho sentido.
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| Comisiones del Consejo General del Instituto | Enlace |
| Comisión de Educación Cívica y Capacitación Electoral | |
| Comisión de Organización Electoral | |
| Comisión de Partidos Políticos, Registro y Prerrogativas | |
| Comisión de Quejas y Denuncias, y de Procedimiento Contencioso Electoral | |
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| Comisión de Igualdad de Género y No Discriminación | |
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